原標(biao)題：首個對葉榕完整(zheng)基因組(zu)發(fa)布

本(ben)報北京4月9日(ri)電（記者(zhe)楊舒）對葉(xie)榕是一種(zhong)廣(guang)泛分布于我國南方的(de)植物。近(jin)日(ri)，中(zhong)國農(nong)業(ye)科學院(yuan)深圳農(nong)業(ye)基(ji)因(yin)(yin)組研究所農(nong)業(ye)基(ji)因(yin)(yin)組學技術(shu)研發(fa)(fa)與應用(yong)創新團隊(dui)發(fa)(fa)布首個(ge)對葉(xie)榕的(de)完(wan)整(zheng)(zheng)基(ji)因(yin)(yin)組，修正(zheng)了(le)此(ci)前學界對其(qi)基(ji)因(yin)(yin)組測序繪制中(zhong)存在的(de)大(da)量(liang)間隙和(he)組裝錯誤，大(da)幅提升了(le)對葉(xie)榕基(ji)因(yin)(yin)組的(de)連續性、完(wan)整(zheng)(zheng)性和(he)準確性，為榕屬植物性別演化提供了(le)重要資源。

據介紹，榕(rong)(rong)(rong)樹是桑科榕(rong)(rong)(rong)屬800多種植(zhi)物(wu)的(de)(de)(de)統稱，廣泛分布(bu)于熱帶和(he)亞熱帶地區。榕(rong)(rong)(rong)屬植(zhi)物(wu)包含6個亞屬，一半雌(ci)雄(xiong)同株（單棵榕(rong)(rong)(rong)樹上包含正常(chang)的(de)(de)(de)雌(ci)花(hua)(hua)和(he)雄(xiong)花(hua)(hua)），一半功能性(xing)雌(ci)雄(xiong)異(yi)(yi)株（雌(ci)榕(rong)(rong)(rong)樹僅含有(you)雌(ci)花(hua)(hua)，雄(xiong)榕(rong)(rong)(rong)樹包含雄(xiong)花(hua)(hua)和(he)短花(hua)(hua)柱雌(ci)花(hua)(hua)）。其中(zhong)，對(dui)葉榕(rong)(rong)(rong)是聚果榕(rong)(rong)(rong)亞屬比較(jiao)古老的(de)(de)(de)雌(ci)雄(xiong)異(yi)(yi)株植(zhi)物(wu)，具有(you)明顯的(de)(de)(de)性(xing)別分化。從生物(wu)學角度看，解析對(dui)葉榕(rong)(rong)(rong)的(de)(de)(de)基(ji)(ji)因(yin)(yin)組(zu)對(dui)研究榕(rong)(rong)(rong)屬植(zhi)物(wu)性(xing)別分化及相關(guan)生物(wu)學性(xing)狀和(he)基(ji)(ji)因(yin)(yin)功能至(zhi)關(guan)重要，然而，此前對(dui)葉榕(rong)(rong)(rong)基(ji)(ji)因(yin)(yin)組(zu)存在(zai)大(da)量(liang)的(de)(de)(de)信息缺失和(he)組(zu)裝錯(cuo)誤，阻(zu)礙了進一步的(de)(de)(de)研究。

在國家自然(ran)科學基(ji)金等項目的支持下(xia)，科研團隊綜合利用多種測(ce)序技(ji)術，在原有(you)基(ji)因組(zu)基(ji)礎上(shang)(shang)重新(xin)組(zu)裝、完善，發布了(le)(le)首個對(dui)葉榕所有(you)染色體端(duan)粒到端(duan)粒完整無間隙的基(ji)因組(zu)。該(gai)基(ji)因組(zu)大(da)小(xiao)371.8兆，所有(you)序列均掛載到14條(tiao)染色體上(shang)(shang)，成功注釋了(le)(le)26642個編碼蛋白基(ji)因，經評估，基(ji)因組(zu)的完整度、連續(xu)性(xing)和(he)準確(que)性(xing)均得(de)到了(le)(le)大(da)幅提升。

另(ling)據了解，科研團隊(dui)還(huan)進一步組裝(zhuang)榕屬(shu)植物首個完整(zheng)的性(xing)別(bie)決定區(qu)域，鑒定榕樹的性(xing)別(bie)決定基因(yin)，并構(gou)建對葉(xie)榕雄性(xing)和雌性(xing)花不同發育(yu)時期的基因(yin)調控網絡(luo)，從而發現雄花發育(yu)的關鍵基因(yin)。

(責編(bian)：楊曦、陳鍵)

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